Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NTRK3Q16288 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NTRK3Q16288 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NTRK3Q16288 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NTRK3Q16288 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NTRK3Q16288 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NTRK3Q16288 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NTRK3Q16288 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NTRK3Q16288 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NTRK3Q16288 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NTRK3Q16288 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NTRK3Q16288 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NTRK3Q16288 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NTRK3Q16288 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK3Q16288 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK3Q16288 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK3Q16288 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK3Q16288 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK3Q16288 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK3Q16288 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK3Q16288 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK3Q16288 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NTRK3Q16288 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK3Q16288 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK3Q16288 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK3Q16288 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK3Q16288 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK3Q16288 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NTRK3Q16288 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK3Q16288 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK3Q16288 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK3Q16288 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK3Q16288 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK3Q16288 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK3Q16288 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NTRK3Q16288 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NTRK3Q16288 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NTRK3Q16288 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NTRK3Q16288 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms