Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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CNGA3Q16281 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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CNGA3Q16281 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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CNGA3Q16281 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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CNGA3Q16281 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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CNGA3Q16281 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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CNGA3Q16281 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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CNGA3Q16281 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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CNGA3Q16281 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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CNGA3Q16281 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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CNGA3Q16281 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CNGA3Q16281 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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