Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
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SNCBQ16143 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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SNCBQ16143 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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SNCBQ16143 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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SNCBQ16143 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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SNCBQ16143 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SNCBQ16143 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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