Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKIV2LQ15477 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms