Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CHD4Q14839 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHD4Q14839 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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