Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KCNB1Q14721 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms