Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF235Q14590 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF235Q14590 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF235Q14590 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF235Q14590 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF235Q14590 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF235Q14590 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF235Q14590 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF235Q14590 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ZNF235Q14590 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms