Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SQLEQ14534 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SQLEQ14534 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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