Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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PDE6HQ13956 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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PDE6HQ13956 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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PDE6HQ13956 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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PDE6HQ13956 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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PDE6HQ13956 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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PDE6HQ13956 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
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PDE6HQ13956 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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PDE6HQ13956 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
PDE6HQ13956 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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