Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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FHL3Q13643 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FHL3Q13643 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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