Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKD2Q13563 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
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