Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EIF4EBP1Q13541 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
EIF4EBP1Q13541 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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