Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ATRQ13535 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ATRQ13535 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATRQ13535 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
ATRQ13535 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATRQ13535 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ATRQ13535 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ATRQ13535 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms