Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGCGQ13326 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SGCGQ13326 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
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