Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SEMA3FQ13275 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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