Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM28Q13263 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM28Q13263 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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