Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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ERCC8Q13216 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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ERCC8Q13216 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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ERCC8Q13216 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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ERCC8Q13216 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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ERCC8Q13216 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ERCC8Q13216 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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ERCC8Q13216 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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ERCC8Q13216 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERCC8Q13216 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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