Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SEMA3BQ13214 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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