Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PSMD2Q13200 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms