Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MKRN3Q13064 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MKRN3Q13064 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
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