Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CDC16Q13042 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CDC16Q13042 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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