Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GRIK2Q13002 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIK2Q13002 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms