Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HSPB3Q12988 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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