Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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NPRL3Q12980 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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NPRL3Q12980 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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NPRL3Q12980 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NPRL3Q12980 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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