Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC10A2Q12908 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms