Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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LMAN2Q12907 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LMAN2Q12907 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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