Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GRIN2AQ12879 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
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GRIN2AQ12879 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
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GRIN2AQ12879 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
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GRIN2AQ12879 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
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GRIN2AQ12879 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN2AQ12879 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
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