Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BPTFQ12830 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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