Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC15Q0P6D6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms