Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSRP1Q08945 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms