Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDR1Q08345 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDR1Q08345 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms