Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
COL16A1Q07092 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL16A1Q07092 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms