Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PAX8Q06710 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms