Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SRSF11Q05519 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SRSF11Q05519 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms