Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GBE1Q04446 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms