Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GCNT1Q02742 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GCNT1Q02742 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GCNT1Q02742 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GCNT1Q02742 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GCNT1Q02742 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GCNT1Q02742 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GCNT1Q02742 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GCNT1Q02742 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GCNT1Q02742 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GCNT1Q02742 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GCNT1Q02742 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GCNT1Q02742 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GCNT1Q02742 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GCNT1Q02742 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GCNT1Q02742 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GCNT1Q02742 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GCNT1Q02742 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GCNT1Q02742 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GCNT1Q02742 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GCNT1Q02742 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms