Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CYP27A1Q02318 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP27A1Q02318 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms