Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CENPEQ02224 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CENPEQ02224 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms