Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNC1Q01954 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BNC1Q01954 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms