Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EXOSC10Q01780 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EXOSC10Q01780 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms