Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CACNA1DQ01668 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CACNA1DQ01668 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms