Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FANCCQ00597 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FANCCQ00597 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms