Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2BQ00403 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2BQ00403 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms