Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAT1AQ00266 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAT1AQ00266 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms