Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2IP78347 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2IP78347 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms