Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RND3P61587 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RND3P61587 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RND3P61587 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RND3P61587 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RND3P61587 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RND3P61587 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RND3P61587 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RND3P61587 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RND3P61587 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RND3P61587 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RND3P61587 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RND3P61587 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RND3P61587 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RND3P61587 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RND3P61587 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RND3P61587 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RND3P61587 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms