Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERVPABLB-1P60509 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms