Protein–RNA interactions for Protein: P59826

BPIFB3, BPI fold-containing family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFB3P59826 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPIFB3P59826 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms