Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC01547P58512 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms