Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
EEFSECP57772 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EEFSECP57772 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms